Элементы генэкологии начали складываться еще в прошлом веке. К ним относятся изучение мелких внутривидовых форм из разных местообитаний в условиях питомника (работы Е. Алмквиста, А. Жордана, А. Декандоля), выделение групп особей со сходной фенотипической реакцией на внешние факторы — «изореагенты» (К. Раункиер), «сезонные расы» (Р. Веттштейн и Н. В. Цингер), «расы» и «фреквенции» (И. К. Пачоский), «биологические виды» (Н. А. Холодковский и Ю. А. Филипченко).
В работах М. А. Мензбира, Б. А. Келлера неоднократно подчеркивалась необходимость исследования экологических факторов для решения проблем систематики и эволюционной теории.
Основателем генэкологии в ботанике считается Г. Турессон (Turesson, 1922а, 19226, 1923). Он сформулировал ее задачи и методы, ввел основные понятия (экотип, экофен, эковид, генэкология). Развитие генэкологии за рубежом в основном было сосредоточено в трех центрах: в Швеции во главе с Турессоном, в Англии (Дж. Грегор с сотрудниками, У. Туррил, Д. Хеслоп-Харрисон, Д. Валентайн) и в США (Дж. Клаузен, Д. Кек, Ф. Клементс, У. Хизи, X. Холл). Среди скандинавских ученых (Т. Бехер, А. Густафсон, К. Ларсен, М. Мюнтцинг, О. Хагеруп) наиболее сильной оказалась тенденция генетико-кариологических исследований дифференциации вида.
В работах английских исследователей центральное место заняло изучение постепенных последовательных изменений отдельных признаков растений в соответствии с градиентом условий среды (клинальная изменчивость), а также проблемы описания и классификации внутривидовых таксонов (биосистематика). В США проводилось не только наиболее комплексное изучение объектов на уровне «подвид— экотип», но и разработка концепции адаптивной структуры популяции. Значительную роль при этом сыграла организация серии стационаров в разных климатических л высотных зонах, возможность проведения физиологических экспериментов в контролируемых условиях.
Публикации первых генэкологических работ советских исследователей (Е. Н. Синской — по крестоцветным, М. А. Розановой — на лютиках) появились в 1922—1924 гг. На первых порах в них иллюстрировались уже описанные Турессоном закономерности. Но так как начало их исследований относится к 1920—1921 гг., а на направленность их работ повлияли идеи Н. И. Вавилова и Ю. А. Филипченко, Синскую и Розанову по праву относят к числу основателей генэкологии. Генэкологическое направление оказалось наиболее подходящим для реализации уже оформившихся замыслов.