В нашей стране исследования по белковому полиморфизму популяций были развернуты во второй половине 60-х годов.
К. П. Алтухов с большой группой сотрудников, используя иммунологические и биохимические методы, провел тщательные исследования генетической структуры локальных стад ряда видов рыб, различающихся по экологии (Алтухов и др., 1972; Алтухов, 1974). Между всеми стадами в пределах вида обнаружена генетическая дивергенция, указывающая на их репродуктивную изоляцию. В то же время каждое отдельное стадо характеризуется существенной наследственной разнородностью и своей структурой (системой субпопуляций). Отдельные стада рыб обнаруживают устойчивость во времени и пространстве, несмотря на постоянную изменчивость слагающих их структуру субпопуляций. Такие же закономерности характеризуют бисексуальные виды других систематических групп (Алтухов, Рычков, 1970). Все эти факты имеют не только теоретическое, но и важное практическое значение для планирования путей использования и воспроизводства природных ресурсов.
Привлекают внимание исследования белкового полиморфизма, осуществленные на рыбах В. С. Кирпичниковым (1979). На нерке (Oncorhynchus nerka) им установлена четкая клинальная изменчивость по локусу лактатдегидрогеназы (Ldh). Частота аллеля B1 данного локуса увеличивается по мере продвижения к северу как вдоль азиатского, так и американского побережий Тихого океана. Изменение частоты аллеля Ldh—B1 коррелировано с температурными условиями обитания молоди нерки в пресных водах, до ее ската в океан. На этом же объекте показан моногенный гетерозис при сочетании различных аллелей локуса Pgm-1 (фосфоглюкомутаза). Продемонстрировано непосредственное действие естественного отбора па изменение частот аллелей в популяциях рыб. Заражение карпов краснухой приводит к сдвигам в частотах аллелей локусов Tf и Est-F. Кирпичников был организатором нескольких всесоюзных совещаний, посвященных биохимическому и кариологическому полиморфизму рыб.
В комплексных исследованиях популяций разных видов млекопитающих, осуществляемых Воронцовым с сотрудниками, важное место занимает анализ полиморфизма по белкам. Использование этого метода способствует выяснению вопроса о генетической дивергенции и обособленности как отдельных популяций, так и более крупных внутривидовых группировок (Воронцов и др., 1977).