Отечественными авторами также была выполнена серия работ по изучению кариотипической структуры популяций на базе инверсий.
В процессе этих экспериментов они проследили взаимодействие отдельных факторов эволюции и творческую роль естественного отбора в формировании кариотипической структуры популяций. Исследуя кариотипы шести диких видов Drosophila (D. melanogaster, D. funebris, D. obscura, D. transversa и два не определенных вида) и 5 популяций Chironomus из многих географических пунктов средней России, Северного Кавказа, Закавказья, Средней Азии, Крыма, Поволжья и других регионов, авторы (Дубинин, Соколов, Тиняков, 1937; Дубинин, Соколов, 1940; Н. Н. Соколов, Дубинин, 1940) подтвердили большую распространенность хромосомных аберраций.
В основном это были инверсии, очень редко перестановки. Обнаружились также определенные закономерности в географическом распределении различных инверсий: одни инверсии оказались широко распространенными по ареалу вида, другие имели узко локальное распространение. Кроме того, была отмечена специфичность кариотипической структуры каждой популяции в отношении насыщенности ее данной инверсией и разнообразия последних. Получив большой фактический материал, авторы пытались выяснить основные факторы, которые могут способствовать эволюционному преобразованию кариотипической структуры популяций, а именно взаимодействие мутационной изменчивости хромосом, изоляции, панмиксии, генетико-автоматических процессов и естественного отбора. Наибольшую важность представляет изучение роли естественного отбора в регуляции насыщенности популяций данной аберрацией и, следовательно, в формировании их кариотипической структуры.
Ряд работ Дубинина и Тинякова, выполненных в 40-х годах на Drosophila funebris, был посвящен изучению действия естественного отбора на формирование кариотипической структуры локальных популяций этого вида по насыщенности их инверсиями. При сравнении популяций, обитающих в условиях большого города (Москва) и в сельской местности (окрестности г. Москвы), обнаружилось разнонаправленное действие отбора, что продемонстрировало его влияние на процесс кариотипической дивергенции в разных экологических условиях (Дубинин, Тиняков, 1946б). Повторив подобное исследование через 20 лет, А. И. Борисов (1969) подтвердил правильность выводов Дубинина и Тинякова. Он показал, что имеет место дальнейшая дивергентная эволюция экологических рас D. funebris на базе хромосомного полиморфизма в связи с расширением экологических условий города.