Установив существование связи структурной изменчивости хромосом с эволюционным процессом, Навашин пытался проследить ее характер при видообразовании.
Сравнительный анализ морфологии хромосом у десяти видов Crepis (1928) подтвердил предположение о значении мелких хромосомных мутаций в видообразовании, показал постепенность морфологических изменений гомологичных хромосом у филогенетически связанных видов. Постепенность в изменениях длины хромосом дала основание Навашину приписать этому процессу филогенетический характер, а появление новых признаков рассматривать как следствие длительной аккумуляции количественных изменений хромосом.
Морфология хромосом у десяти видов p. Crepis (по: Навашин, 1928).
Структурная изменчивость хромосом привела Навашина к выводу об ее важности в обеспечении ряда эволюционных изменений, например основного числа хромосом, нарушения аллеломорфизма при автополиплоидии. Кроме того, Навашин подчеркивал значение перемещения Участков хромосом, в частности транслокаций, или, согласно его терминологии, дислокаций, для создания барьера нескрещиваемости (М. С. Навашин, 1964, 1936а).
Фролова (1936) обнаружила в массовых культурах четырех видов Drosophila широкое распространение различного типа хромосомных аберраций (инверсии, нехватки) как в аутосомах, так и в половых хромосомах.