Важная особенность современного дарвинизма состоит в замене типологического (организмоцентристского) подхода к пониманию субстрата эволюции качественно новым популяционным, основывающимся на признании элементарной единицей эволюции местной (локальной) популяции.
Основу современной теории эволюции составляют не данные эволюции крупных систематических групп, интерпретация которых неизбежно включает много гипотетического, а факты, получаемые в исследованиях микроэволюции. Эти факты добываются путем непосредственного экспериментального исследования элементарных эволюционных процессов, протекающих в популяциях.
Выделение популяционно-видового уровня организации в качестве субстрата эволюции обусловило большой интерес к исследованиям структуры вида и основных типов видообразования. Было установлено, что вид состоит из одной или нескольких местных популяций, что как результат эволюции он находится в стабильном состоянии и характеризуется обособленностью от остальных видов и целостностью, а как носитель эволюции неустойчив, имеет составной характер и расплывчатые границы. Изучались механизмы интеграции местных популяций и вида и различные формы их дифференциации, рассматривался вопрос о неравноценности видов и классификации их на типы (по возрасту, по распространенности, по широте адаптаций, по способу размножения, по внутреннему строению и др.).
В настоящее время различается несколько типов видообразования. По пространственным отношениям видообразование подразделяется на аллопатрическое, при котором эволюирующие группы пространственно разобщены, и симпатрическое, при котором эти группы являлись первоначально членами одной местной популяции. По размерам исходных преобразований, по времени изоляции новой формы и темпам самого процесса можно различать медленное видообразование путем накопления в популяциях многих мелких адаптивных изменений («микроаккумулятивное»), или быстрое — на основе размножения резко измененных мутантных форм, с самого начала репродуктивно изолированных от исходного вида (называемого «внезапным», «мгновенным», «неоформогенным»).
Выделяют видообразование путем разделения исходного вида на несколько рас с последующей их адаптивной радиацией и превращением в новые виды («расщепляющее видообразование», «сегрегациогенез»); путем образования нового вида на основе объединения генетической информации двух или нескольких исходных видов в результате отдаленной гибридизации, трансдукции, трансформации, симбиогенеза и пр. («синтезогенез»); путем преобразования исходного вида в один дочерний («ортоселекция», «филетическое видообразование»).