Истолкование данных генетики с позиции принципа неизменности наследственной субстанции, по-видимому, было главной причиной, вызвавшей противопоставление генетики дарвинизму в первой четверти XX в.
Данные гибридологического анализа, экспериментальное разложение гетерозигот на гомозиготные, далее не расщепляющиеся линии, получение инцухт-линий и чистых линий у растений-самоопылителей, отрицательные результаты первых попыток вызвать наследственные изменения под влиянием внешних условий привели к концепции постоянства генов и независимости их от воздействий внешней среды. Этот период в развитии генетики справедливо характеризуется как метафизический.
Существенным поводом для столкновения менделизма с дарвинизмом: послужили результаты исследований эффективности отбора в чистых линиях фасоли, проведенные в 1903 г. В. Иоганнсеном. Отбирая фасоль по весу и размеру семян в течение нескольких поколений, он пришел к выводу о бессилии отбора в чистых линиях. Естественный отбор, по мнению Иоганнсена, может только сокращать уже имеющееся многообразие гетерозиготных комбинаций, но не может создать ничего нового.
Антидарвинистские истолкования основных данных генетики в первые два десятилетия ее развития породили ряд эволюционных концепций, названных генетическим антидарвинизмом (Завадский, 1973). В нем сложилось три направления: мутационизм, гибридогенез и преадаптационизм.
Мутационизм абсолютизировал значение крупных мутаций, ошибочна признавал существование «видообразовательной изменчивости», рассматривая ее в качестве единственной причины усложнения организации и эволюции вообще. Широкую популярность приобрела «Теория мутаций» де Фриза (de Vries, 1901—1903). Изучая изменчивость у ослинника (Oenothera) и наблюдая появление резко уклоняющихся форм, де Фриз выдвинул теорию скачкообразного видообразования, происходящего под влиянием автогенетических факторов. Отбор же выполняет чисто элиминирующую функцию, устраняя неудачные виды.