Круг основных вопросов, на решение которых направлены исследования, финансируемые РФФИ, можно сгруппировать следующим образом.
1. Таксономия и инвентаризация видового состава слабо изученных групп организмов - грибов, лишайников, мохообразных, водорослей, из животных - нематод, кольчатых червей, моллюсков, паукообразных, отдельных отрядов насекомых, рыб, а также глубоководной фауны высокоширотной Арктики.
2. Климатогенные тренды биологического разнообразия высоких широт в связи с проблемами моделирования и прогнозирования последствий глобальных изменений.
3. Эволюция экосистем северной Азии и проблемы биотогенеза Арктики; трансберингийские связи и формирование современной регионально-секторной и зональной структуры биоты.
4. Анализ сохранности и жизнеспособности разных групп организмов в захороненных и вечномерзлых грунтах (эколого-физиологические, эволюционные, синэкологические интерпретации).
5. Антропогенная динамика экосистем, растительности и границы леса.
6. Разнообразие и типология видовых ареалов и биогеографическое районирование Арктики (в основном на примере мохообразных, цветковых растений, наземных членистоногих, морских беспозвоночных, млекопитающих).
7. Состав флоры и фауны, структура сообществ полярных пустынь как маргинальной части глобального тренда биоразнообразия.
8. Механизмы адаптации и адаптивные стратегии организмов в условиях Арктики в связи с концепциями «экстремальной экологии».
9. Разнообразие вариантов метаболизма арктических видов и трофо-энергетических отношений в экосистемах, в том числе в связи с проблемами оценки продукционных возможностей и эксплуатации биоресурсов (на примере рыб, грызунов, насекомых).
10. Роль видового разнообразия, межвидовых и внутривидовых отношений в системе факторов динамики популяций и механизмов ее регуляции (в основном на примере млекопитающих и птиц).
11. Проблемы эволюционной экологии: изменчивость, внутривидовой полиморфизм, микроэволюционные процессы, видообразование (в основном на примере рыб, отчасти - грызунов и цветковых растений).
Ниже приводится обзор тематики и результатов основных направлений отечественных исследований биологического разнообразия Арктики.