Основу для решения таких вопросов дает детальное изучение сукцессий, выяснение специфики развития экосистем. Только зная, как протекает сукцессия, можно направлять рекультивационные процессы.
Проблемы утилизации органических отходов городов и сельскохозяйственного производства. Разработка контейнеров биотермического обеззараживания, гумификации и минерализации органических отбросов; создание замкнутых циклов с использованием разнообразных групп организмов, участвующих в процессах утилизации органического вещества и дающих определенный выход биологической продукции, используемой в последующих звеньях единого производства. В основе решения проблемы лежит теория трофо-энергетического функционирования экосистем и круговорота вещества.
Переход от промысла к хозяйству. Экология призвана решать эту важнейшую проблему современного этапа развития хозяйственной деятельности человека. Необходима разработка принципов и стратегии перехода от «собирательства» - к высокопродуктивному земледелию, от «охоты» - к культурному хозяйствованию. Таковы, например, полувольное и вольерное разведение промысловых животных и полное приручение их; создание морских аквакультур рыб и промысловых беспозвоночных, мощных рыборазводных комплексов, организация питомников для выращивания молоди различных видов используемых животных, создание селекционно-генетических станций и т.д. Для решения проблемы потребуются обширные исследования жизненных циклов, этологии, генетики, процессов размножения, трофических отношений используемых видов и т.д., акклиматизационные и реакклиматизационные мероприятия в широких масштабах; глобальное использование генофонда различных групп животных и растений.
Сохранение эталонных участков биосферы - разработка системы заповедного дела, направленной на длительное сохранение наиболее типичных ландшафтов, озер и других водоемов, экосистем, отдельных видов животных и растений разных природных зон и поясов. Необходимо создание системы заповедных участков с разной степенью вмешательства человека в экосистему, от абсолютно заповедных до поддерживаемых человеком при заданном режиме. Заповедники следует рассматривать как экологические лаборатории, в которых могут быть выяснены многие аутэкологические и синэкологические вопросы.