Юго-восток области занят отрогами Салаирского кряжа, прорезанными густой речной сетью. Самые крупные реки — Бердь и Иня — правые притоки Оби.
Русло Берди очень извилистое, с длинными плесами и короткими галечными перекатами. Ширина его у с. Маслянино не превышает 30—40 м, глубина доходит до 3—4 м. Течение спокойное, со скоростью 0,2—1,5 м/сек. Температура воды с мая по октябрь колебалась от 10 до 23° (наблюдения 1959 г.).
В Берди развивается не менее пяти видов мошек. Самый многочисленный— S. galeratum Edw., довольно часто встречаются В. transiens Rubz., S. morsitans longipalpe Belt., S. nolleri Fried., очень редко — Od. ornata Mg. и В. erythrocephala De Geer.
Река Иня несколько меньше, ее ширина у ст. Издревая — около 20—30 м, глубина — 1,2—2 м. Летом она сильно мелеет, образуя многочисленные броды. Ложе реки преимущественно каменистое, течение быстрое — 0,5—0,9 м/сек. Температура воды летом достигает 25°. Водная растительность богатая: многочисленны рдесты, стрелолисты, кубышки и другие водные растения. К середине лета все дно реки покрывается озерным камышом. В р. Иня в массе выплаживаются 5. galeratum Edw. н S. morsitans longipalpe Belt., изредка встречается В. erythrocephala De Geer., E. latipes Mg. и E. pugmaeum Zett.
Притоки Берди и Инн — небольшие речки (Зырянка, Филимониха, Матренка, Суенга, Кипрюшка, Издревянка, Крохалевка и др.) с порожистым руслом и быстрым течением — до 1,8 м/сек. Ширина их составляет 0,5—2,5 м, глубина — от 0,3 до 1 м. Температура воды летом не превышает 10—17°. Берега в густых зарослях осоки, встречаются калужница, аир. Плотность поселения личинок и куколок в этих водотоках необычайно велика и в июле — августе достигает 200—600 особей на 1 дм2 субстрата. В одном из ручьев, впадающих в р. Суенга, в июле 1959 г. плотность поселения личинок на 1 дм2 листьев осоки составляла 3350 особей. В этих речках обнаружено девять видов мошек. Самый многочисленный из них — Od. ornata Mg., часто встречаются Е. latipes Mg., S. vulgare Rubz., реже — S. aemulum Rubz., S. morsitans longipalpe Belt., E. silvestre Rubz., S. pygmaeum Zett., S. erythrocephala De Geer.