Лепидозавры и архозавры
Группа диапсида включает два подкласса: лепидозавров и архозавров.
Наиболее раннюю (верхняя пермь) и наиболее примитивную группу липидозавров составляет отряд эозухий (Eosuchia). Они еще очень плохо изучены, лучше других известна Jounginia — мелкое, напоминающее телосложением ящерицу пресмыкающееся со сравнительно слабыми конечностями, имевшими обычное рептильное строение. Примитивные черты ее выражаются главным образом в строении черепа, в частности в строении затылочного отдела и неба. Имелось теменное отверстие, зубы располагались как на челюстях, так и на нёбе.
Первые клювоголовые (Rhinchocephalia) известны с раннего триаса. Некоторые из них были чрезвычайно близки к современной гаттерии. Отличия клювоголовых от эозухий заключаются в присутствии рогового клюва и в том, что зубы их приращены к кости, тогда как челюстные зубы эозухий сидели в отдельных ячейках. По последнему признаку клювоголовые даже примитивнее эозухий, и, следовательно, должны были произойти от каких-то еще не найденных примитивных форм последней группы.
Чешуйчатые (Squamata), именно ящерицы, известны лишь с самого конца юры. От основного ствола чешуйчатых — ящериц — уже в начале мела, видимо, отделились мозазавры (Mosasauria). Это были морские пресмыкающиеся, имевшие длинное змеевидное тело и две пары конечностей, видоизмененных в ласты. Некоторые представители этого отряда достигали длины 15 м. В конце мела они бесследно вымерли. Несколько позже мозазавров (конец мела) от ящериц отделились змеи.
Обобщенное родословное дерево рептилий (по А. Ромеру):
1 — основной корень рептилий (котилозавры) — сеймуриа (Seumouria), 2 — черепахи (Chelonia), 3 — ихтиозавры (Ichtyosauria), 4 — плезиозавры (Plesiosauria), 5 — архозавры (Archosauria), 6 — чешуйчатые (Squamata), 7 — ящерицы и змеи, 8 — примитивные звероподобные рептилии, 9 — высшие звероподобные рептилии, 10 — млекопитающие (Mammalia)