Толщина слоя грунта зависит от размеров частиц субстрата и размера растений, посаженных в аквариум. Чем меньше частицы субстрата, тем тоньше должен быть слой грунта, потому что с уменьшением частиц ухудшается газообмен в грунте.
Например, для мелкого речного песка, который вопреки рекомендациям иногда применяют, слой грунта должен быть не больше 1,2—2 см. Крупный речной песок можно уложить слоем до 4—5 см, что вполне устроит большинство растений. Мелкая галька может быть насыпана слоем до 7 см.
Обычно большей толщины грунта для растений и не требуется. В тех случаях, когда при выращивании очень крупных растений применяется средний и крупный гравий или галька, толщина слоя может доводиться до 12—15см, но в любительских аквариумах это делается край не редко.