Вид делится на три подвида.
В водах России один подвид: Северный голубой кит, В.m. musculus Linnaeus, 1758.
Размеры относительно небольшие. Средняя длина самцов 22,8, самок — 23,5 м. Максимальная (самки) — 29,8 м.
Баренцево море (по-видимому, истреблен). Дальневосточные воды — район Курильских островов, восточное побережье Камчатки.
Вне России — Северная половина Атлантического и Тихого океанов.
Морфологические исследования китов Северного полушария, обитающих в Атлантическом и Тихом океанах, не выявили каких-либо различий между ними, хотя географически обе популяции, очевидно, полностью изолированы. В северной части Атлантического океана, вероятно, существуют более мелкие локальные популяции голубых китов, каждая из которых в случае снижения численности не пополняется за счет других (Jonsgard, 1955 а, в). Возможно то же имеет место и в северной части Тихого океана. Однако вопрос этот не изучен и взаимосвязь китов, обитающих у азиатских и американских берегов, не ясна.
Для всех районов Южного полушария принимаются два подвида:
1. Южный голубой кит, В. m. intermedia Burmeister, 1866.
Крупнее северного. Средняя длина тела самцов 23,4 м, самок - 24,3 м. Максимальная (самки) — 33,3. При одинаковой длине тела южные киты оказываются более молодыми, чем северные.
Распространен в морях Южного полушария, включая воды Антарктики. Вопрос о существовании локальных популяций не изучен. Биологические ритмы этого подвида по сравнению с северным смещены на 6 мес.
2. Малый голубой кит (пигмей), B.m. brevicauda Zemsky et Boronin, 1964.
Мельче даже северных голубых китов. Средняя длина тела самцов из района о-ва Кергелен 21,9 м, самок — 22,3 м. Максимальная длина самцов 23,5 м, самок — 24,1 м (Ochihara, 1961). Во внешних морфологических признаках существуют заметные отличия от обыкновенных голубых китов, что подтверждает правомочность выделения их в самостоятельный подвид (Сажинов, 1970). Половой зрелости достигают при меньших размерах. Окраска очень слабо отличается от окраски номинальной формы. Ареал занимает большую часть Индийского океана севернее 57° ю.ш., затем Тасманово море. Встречается в водах Австралии и иногда в юго-восточной части Атлантического океана. Северной границей служит Аденский залив, северная часть Аравийского моря, Оманский залив, южная часть о-ва Шри-Ланка, море Банда (Ochihara, 1961, 1966; Земский, Сажинов, 1982). Годовой ритм жизни такой же, как у южного голубого кита.